أولاً يجب تناول الثوم نيئاً، لأن الثوم يفقد تأثيره السحري بسرعة عند تعرضه للحرارة، ومن الأفضل ترك الثوم مهروساً لمدة 10-15 دقيقة، وأفضل تأثير هو تناوله بعد إنتاج الأليسين بالكامل. ومن الأمور التي يجب مراعاتها هو أنه لا ينبغي تناول الثوم على معدة فارغة لأنه يسبب تهيجاً وتآكلاً شديدين، ويمكن أن يسبب عدم ارتياح في المعدة، كما يجب عدم الإفراط في تناول الثوم لأنه يمكن أن يؤثر على امتصاص فيتامين ب، والذي يمكن أن يكون له تأثير منشط للعينين، مما يسبب التهاب الجفن والتهاب الملتحمة، لذلك من الأفضل تناول الثوم مرة واحدة في اليوم أو كل يومين، مع 3 فصوص في كل مرة.
إذا كنت تخشى أن يكون هناك طعم غير سار في فمك بعد تناول الثوم، فإن شرب كوب من القهوة أو الحليب أو الشاي الأخضر بعد تناول الثوم يمكن أن يساعد في تنقية أنفاسك.